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neuroimagen:notas_f5cehbi

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neuroimagen:notas_f5cehbi [2021/07/23 09:20]
osotolongo [Seguimiento de los PET]
neuroimagen:notas_f5cehbi [2022/09/05 14:58] (current)
osotolongo [Seguimiento de los PET]
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 y esto demora un poco pues compacta cada PET y lo sube a XNAT. y esto demora un poco pues compacta cada PET y lo sube a XNAT.
 +
 +===== FIX para las MRI viejas y la web de IXICO =====
 +
 +Si la web de IXICO no encuentra ningun DICOM en el directorio de Corachand, hay que correr //dcmconv// sobre cada dicom. (Ver https://github.com/DCMTK/dcmtk)
 +
 +Ejemplo,
 +
 +<code bash>
 +
 +[osotolongo@brick03 F099]$ for x in `find /nas/corachan/facehbi/F099/ -type f`; do y=$(echo ${x} | sed 's/.*F099\/\(.*\)/\1/;s/(/_/;s/)/_/'); d=$(echo ${y} | awk -F"/" '{print $1}'); f=$(echo ${y} | awk -F"/" '{print $2}'); if [ ! -d ${d} ]; then mkdir ${d}; fi; dcmconv ${x} ${d}/${f}; done
 +</code>
  
  
neuroimagen/notas_f5cehbi.txt ยท Last modified: 2022/09/05 14:58 by osotolongo